El Instituto San José de Chipaque pertenece a la Beneficiencia de Cundinamarca. Es un hogar de protección para adolescentes en situaciones de vulnerabilidad.
A partir del año 2010 la parte académica del Instituto esta a manos de la Secretaría de Educación de Cundinamarca. Por tanto se constituyo en una sede del colegio departamental del municipio de Chipaque, Institución Educativa Departamental Pio X, llamada Sede San josé.